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El EAAF trabajó en Zimbabwe entre los años 1999 y 2001 a pedido de Amani Trust, una ONG local que investigó a los desaparecidos en Matabeleland en los años 80, en el contexto de la campaña de exterminio lanzada por R. Mugabe contra la población local.
Miembros del EAAF participaron de varias misiones para capacitar en técnicas de antropología forense a personal local, como así también realizar exhumaciones y análisis de restos óseos de víctimas de conflictos políticos sucedidos entre los años 1970 y 1987.
No se sabe con exactitud cuántas víctimas murieron a principios de la década de 1980, cuando un Zanu recientemente dominante aplastó a su grupo rebelde Ndebele, ZAPU, para manejar la política como un estado de partido único bajo Zanu-PF, pero se cree que fueron varios miles.
La nueva organización no gubernamental que reemplaza a Amani Trust se llama Ukuthula Trust, y está compuesta por un antropólogo forense y activistas que EAAF entrenó en Sudáfrica y Argentina durante los últimos años. Su trabajo se realiza en el marco de la recientemente creada Comisión Nacional de Paz y Reconciliación (NPRC). Se espera que para el período 2020-2021 el EAAF participe de nuevas misiones.