A solicitud del Comité Internacional de la Cruz Roja (CICR), en 2005 el EAAF llevó a cabo una evaluación de la capacidad forense en las zonas de conflicto del norte del país, donde se desarrollaba una guerra civil que, desde 1983 hasta 2009, dejó miles de muertos.
En 2018 y 2019 el EAAF realizó viajes de asesoramiento a pedido de la Oficina de Personas Desaparecidas y del CICR con el objetivo de colaborar con estrategias de búsqueda de personas desaparecidas durante la guerra.
