Desde el 2023 el EAAF cuenta con una representación en Madrid. La delegación se encuentra inscripta en el Registro Nacional de Asociaciones de España. La relación entre el EAAF y diversas instituciones españolas ha ido incrementándose desde el año 2004 y tiene varias líneas de trabajo:
Colaboración con instituciones
Asociación para la Recuperación de la Memoria Histórica (ARMH): de 2004 a la actualidad, asesoría y apoyo (pro bono) en análisis genético tendiente a la identificación de víctimas de la guerra civil en varios casos. Entre ellos se destaca la participación oficial del EAAF en el análisis genético de varios casos incluidos en la “Querella argentina contra los crímenes del franquismo” abierta por la juez argentina María Romilda Servini de Cubría en base al principio de justicia universal en abril del 2010.
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC): participación en el proyecto “Las Políticas de la Memoria” de 2010 a 2017.
Centro de Estudios Jurídicos (CEJ), dependiente del Ministerio de Justicia español: desde 2008 hasta 2010, en el marco del memorándum de entendimiento firmado entre los Ministerios de Justicia español y argentino en relación con la búsqueda de desaparecidos en la Argentina durante la última dictadura militar y dentro del programa de formación continua del Centro de Estudios Jurídicos dependiente del Ministerio de Justicia español, se desarrollaron una serie de cursos teórico-prácticos sobre Antropología Forense impartidos por EAAF dirigidos a miembros del Colectivo del Cuerpo Nacional de Médicos Forenses del Ministerio de Justicia español. Dichos cursos tuvieron lugar tanto en la sede del Equipo Argentino de Antropología Forense, como en Madrid y Santander. En abril de 2025 se impartió un nuevo curso del CEJ, en conjunto con la dirección de Patología del Instituto de Medicina Legal de Madrid, sobre el “Abordaje Interdisciplinar de Cadáveres en Mal Estado”.
Comisión de Españoles Desaparecidos en Argentina: desde 2008 el EAAF trabaja en conjunto con la Comisión la para la construcción del censo de españoles desaparecidos en Argentina en la última dictadura militar. Dicho listado fue finalmente ampliado, incluyendo los archivos de la Embajada de España en Buenos Aires, y enviado oficialmente en diciembre de 2022 por parte del consejero de dicha embajada, a la Secretaría de Estado de Memoria Democrática del Ministerio de Política Territorial y Memoria Democrática de España, para su publicación en el Boletín Oficial del Estado (BOE).
En marzo de 2026, con motivo del 50 aniversario del golpe militar en Argentina, la Secretaría de Estado de Memoria Democrática solicitó al EAAF el envío de la última actualización del listado, que fue incluido en la Declaración Institucional en Reconocimiento a las Víctimas Españolas de la Dictadura Argentina, aprobada por el Consejo de Ministros español el 24 de marzo de 2026 (Orden PJC/267/2026) y publicada en el Boletín Oficial del Estado (BOE) el 25 de marzo de 2026 (BOE 74, disposición 6933).
Proyecto Frontera África-Europa
Desde 2024 la oficina de España lleva a cabo un proyecto conjunto con la dirección de África del EAAF para la evaluación de posibilidades y planificación de la factibilidad de implementar un mecanismo forense de identificación forense de migrantes fallecidos en corredor migratorio que va desde África noroccidental a España, tomando como modelo el Proyecto Frontera que el EAAF desarrolla en el corredor de Centroamérica-México-Estados Unidos.
El proyecto es cofinanciado por el Gobierno Federal de Suiza y el EAAF, en convenio con la Human Rights Clinic de la Universidad de Chicago, realizó un estudio piloto de factibilidad en 2024-2025. Se encuentra en una segunda fase de implementación (2025-2027), en coordinación con la OIM, el CICR y EuroMed Rights.
En 2024, el EAAF, en cooperación con el director de la Unidad de Patología del Instituto de Medicina Legal de Madrid y la Sociedad Española de Patología Forense (SEPAF), organizaron un Grupo de Trabajo Técnico integrado por los responsables de los Servicios de Patología de los IML de áreas de frontera en España más afectados por la problemática (Islas Canarias, Andalucía, Murcia, Comunidad Valenciana, Ceuta, Melilla y Baleares), con la finalidad de establecer un foro de debate y unificación de criterios, en el proceso de identificación de migrantes fallecidos en frontera.
A través de reuniones técnicas presenciales (financiadas por el EAAF) y virtuales, el grupo de trabajo elaboró una serie de conclusiones y recomendaciones dirigidas al Ministerio de Justicia español, y a la oficina del Defensor del Pueblo, sobre identificación de migrantes fallecidos en frontera. En mayo de 2025, el Grupo de Trabajo concluyó la elaboración de la Propuesta de Protocolo de Actuación de los Servicios de Patología Forense para la Gestión e Identificación de Migrantes Fallecidos en Frontera, que fue enviado formalmente al Ministerio de Justicia para su aprobación e implementación.
Georgia
Georgia, en la zona del Mar Muerto, fue territorio de disputas políticas y étnicas en todo el siglo XX. Entre 1990 y 2008 la región atravesó distintos procesos de violencia política vinculados al establecimiento de independencia y reconfiguración luego de la disolución de la Unión Soviética, en especial, con los territorios de Abjasia y Osetia del Sur. Como resultado de los conflictos¡, más de 2.300 personas desaparecidas siguen sin ser encontradas.
Como intermediario neutral y presidente de dos Mecanismos de Coordinación establecidos en 2010 para esclarecer el destino de las personas desaparecidas en relación con estos conflictos, el Comité Internacional de la Cruz Roja (CICR) está apoyando en los procesos de recuperación, análisis e identificación de restos humanos, incluida la notificación y gestión de datos relacionados con estos eventos. El trabajo que se realiza en el marco de estos Mecanismos de Coordinación es puramente humanitario y no está vinculado a ningún proceso político o judicial, no busca atribuir responsabilidades por la muerte de personas desaparecidas ni realizar determinaciones sobre la causa de dicha muerte.
Para ello, de 2013 a 2023 el CICR contrató al EAAF institucionalmente para llevar a cabo los trabajos de recuperación y análisis de estos restos bajo su coordinación general.
Varios de los especialistas forenses georgianos y abjasianos recibieron entrenamiento, además, en el African School for Humanitarian Forensic Action del EAAF en Sudáfrica.
