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Desde 2010 el EAAF ha participado en actividades de capacitación a organizaciones académicas, organismos oficiales y de la sociedad civil en el área de derechos humanos. Desde el año 2011 participa, también, en tareas de investigación relativas al esclarecimiento de casos de violaciones a los derechos humanos presentados por la Comisión de la Verdad de Ecuador (caso hnos. Restrepo).
Por otra parte, el EAAF fue convocado por el Laboratorio de Criminalística y Ciencias Forenses (Ministerio del Interior) para evaluar el estado de las investigaciones forenses en dicho país.
Capacitaciones
De 2017 a 2019 profesionales ecuatorianos del Servicio Nacional de Medicina Legal y Ciencias Forenses, la Fiscalía general del Estado (Comisión de la verdad y DDHH) y la Policía Nacional de Ecuador fueron seleccionados para participar de la Escuela Latinoamericana de Ciencias Forenses y Derechos Humanos. La formación ofrece entrenamiento teórico-práctico en disciplinas involucradas en investigaciones forenses. El entrenamiento multidisciplinario de tres semanas tiene lugar en el Centro Internacional de Capacitación en Ciencias Forenses del EAAF en la Ciudad de Buenos Aires y cuenta con el apoyo del Fondo Argentino de Cooperación Sur-Sur y Triangular (FO.AR) del Ministerio de Relaciones Exteriores y Culto de la República Argentina.