Entre 1964 y 1965, una dictadura cívico militar ocupó el poder en Brasil. Como en Argentina, durante esos años de gobierno represivo fue común el ocultamiento de los cuerpos de las víctimas del terrorismo de Estado.
En 1991, el EAAF fue invitado a Brasil por el grupo no gubernamental Tortura Nunca Mais (Tortura Nunca Más). El objetivo era que supervisar el trabajo de los antropólogos locales que exhumaban una fosa común en el cementerio Ricard Albuquerque, en Río de Janeiro, en busca de los restos de catorce personas desaparecidas. El Equipo también realizó entrevistas preliminares sobre otros casos, colaboró en el análisis de expedientes en el Departamento de Asuntos Políticos y Sociales, donde se reunían cientos de actas sobre personas desaparecidas y ejecutadas en Brasil y otros países, dictó conferencias y seminarios en varias instituciones y fue distinguido en Río de Janeiro con la Medalla Chico Mendes de la Resistencia en reconocimiento de su aplicación de los métodos científicos para la justicia, la verdad y la memoria.
En 1996 y 1997, a partir de un llamado de la Asociación de Familiares de Desaparecidos de Brasil, el EAAF realizó tres misiones que fueron patrocinadas por el Programa Especial Comisión de Investigación para investigar los casos de más de 300 personas asesinadas o desaparecidas durante el gobierno de facto.
Junto a la Comisión de la Asociación de Familiares de Personas Desaparecidas, personal policial y otras asociaciones, el Equipo visitó tres sitios en el estado de Pará donde se creía que había fosas comunes en las que podían hallarse restos de integrantes del movimiento Araguaia, una organización armada que tuvo su accionar entre fines de la década de 1960 y 1974 en la región amazónica. Los lugares investigados fueron: el cementerio de la ciudad de Xambioa, a orillas del río Araguaia; la hacienda Fazenda Fortaleza en Santo Domingo; y las instalaciones abandonadas del Departamento Nacional de Carreteras en la ciudad de Marabá sobre el río Itacaiunas.
En una segunda misión, se realizaron excavaciones en ocho sitios ubicados en los estados de Pará y Tocantins. Los restos humanos encontrados se habían deteriorado por las condiciones y el paso del tiempo y el EAAF recomendó avanzar con la comparación genética con familiares de las posibles víctimas.
En la tercera misión analizó restos óseos de personas asesinadas por las fuerzas de seguridad brasileñas bajo la dictadura militar que habían sido encontradas por sus propios familiares enterradas con nombre falso.
Fosa de Perus
El EAAF viajó en 2013 y 2014 a Brasil a solicitud de la Comisión Especial sobre Muertos y Desaparecidos Políticos y la Secretaría de Derechos Humanos de la Presidencia de la República de Brasil para la investigación de restos óseos de la fosa común del Cementerio de Perus. El trabajo consistió en realizar el análisis antropológico de restos óseos, relevamiento de documentación y la comparación de los resultados obtenidos del estudio de laboratorio con la información disponible y recomendaciones sobre el abordaje de la investigación, además de capacitación a profesionales involucrados en el análisis antropológico.
Desde un primer momento el EAAF, dado su experiencia y resaltó la importancia de realizar una primera selección de casos prioritarios dada la cantidad de esqueletos a analizar (1049) . Esta priorización de casos permitiría en un lapso acotado de tiempo poder obtener muestras óseas de aquellas osamentas que tienen un perfil compatible con los desaparecidos buscados, a fin de realizar análisis genéticos en una primera etapa. Sin embargo dicha sugerencia no fue aceptada.
En 2016, el Equipo viajó a San Pablo a solicitud del Comité Internacional de la Cruz Roja (CICR) con un doble objetivo: reunirse con el grupo de trabajo de Perus, para emitir recomendaciones técnicas sobre la forma de mejorar el proceso de identificación de los restos óseos y dar clases en el seminario “O Processo de Identificação desde uma Perspectiva Integral”, realizado en las instalaciones de la Superintendencia de Policía Técnico-Científica de São Paulo
En 2017 y 2018 integrantes de la Policía Federal de Brasil fueron seleccionados para participar de la Escuela Latinoamericana de Ciencias Forenses y Derechos Humanos, una formación dictada por el EAAF en Buenos Aires que ofrece entrenamiento teórico-práctico en disciplinas involucradas en investigaciones forenses.
En 2022, un integrante del equipo Médico Forense de la Policía Federal de Brasil asistió al Seminario de Investigación de Femicidios – “Estándares Internacionales de Investigación Forense con Perspectiva de Género” realizado por EAAF en su centro de capacitaciones.
Francisco Tenório Cerqueira Jr.
El pianista de la banda de Vinícius de Moraes y Toquinho Tenório Jr. Tenório llegó a Buenos Aires como para una serie de conciertos en el teatro Gran Rex en marzo de 1976. Desapareció al salir de su hotel ubicado a metros de la avenida Corrientes y poco más de un día después, el 20 de marzo de 1976, el cadáver de un hombre fue encontrado en un terreno baldío en calle Belgrano y Ruta Panamericana, partido de Tigre. En ese momento se inició un expediente judicial, le tomaron las huellas dactilares y guardaron sus objetos personales. Su cuerpo fue enterrado sin identidad en el cementerio de Benavídez y la causa terminó archivada. El expediente fue recuperado por la Procuraduría de Crímenes contra la Humanidad y, por orden de la Cámara Federal de Apelaciones en lo Criminal y Correccional de la Capital Federal, se cotejaron las huellas allí registradas con las de Tenório Júnior archivadas en Brasil. En septiembre de 2025, el EAAF notificó a los hijos del pianista brasileño la identificación por huellas dactilares de su padre y en marzo de 2026 restituyó a los familiares objetos personales de Tenório que habían quedado archivados en la causa judicial.
